Se utiliza isoenzimas y marcadores moleculares (RAPD) para estimar la variabilidad genética de 7 poblaciones chilenas de castaño (Castanea sativa Mill.) propagadas por semilla. De 17 loci isoenzimáticos analizados se detectaron 41 alelos; 4 partidores RAPDs generaron 37 marcadores. Se detectó una baja variabilidad genética dentro de las poblaciones usando isoenzimas (FIS=0,027) y marcadores RAPD (Hs=0,02).

Aunque la distancia geográfica entre las poblaciones es considerable, la diferenciación entre ellas no es alta: Gst = 0,095 para RAPD y Fst = 0,101 para las isoenzimas. No se estimaron desviaciones para ley de equilibrio de Hardy-Weinberg, aún cuando estas poblaciones habían estado sometidas a presiones de selección y habían sido introducidas a Chile recientemente, probablemente durante el siglo XIX con la llegada de emigrantes europeos.

El análisis UPGMA basado en el índice de distancia genética de Nei e incluyendo información de isoenzimas estudiados previamente en poblaciones europeas, sugieren a Portugal como el posible centro de origen de las poblaciones chilenas de castaño. La información generada representa una importante contribución a los silvicultores y autoridades locales para determinar un apropiado manejo del castaño, que combine aspectos de productividad con otros de conservación, economía y ecología.